Con imágenes de alta calidad de la naturaleza patagónica y oceánica, El señor de los pingüinos sigue el recorrido de García Borboroglu a través de dos ecosistemas clave para la supervivencia de los pingüinos: Península Valdés y Nueva Zelanda. Durante los 63 minutos de extensión, el documental indaga sobre los trabajos de preservación de las dieciocho especies de pingüinos que habitan el planeta en el marco de una creciente contaminación ambiental.